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Situées à peu près à mi-distance entre la publication des Recherches logiques (1900-1901) et celle des Idées directrices (1913), ces leçons appartiennent à une période décisive durant laquelle Husserl publie très peu, mais où se détermine le sens et la finalité de la phénoménologie : de psychologie descriptive métaphysiquement neutre, celle-ci devient progressivement une philosophie transcendantale. Le cours de 1906/07 thématise cette évolution et la justifie en montrant l’impossibilité, pour la théorie de la connaissance, d’en rester au niveau de la connaissance naturelle sous peine de ne pouvoir lever l’hypothèse du scepticisme et du relativisme.